1月3日晚，孙中山率领亲信将领及少数警卫部队，亲登“同安”、“豫章”两舰，驶到中流砥柱炮台指挥开炮，向督军署轰击，同时命令朱执信促李耀汉、李福林等同时发难，许崇智、邓铿、罗翼群协助陈炯明响应举事。孙中山亲发数炮，又督促炮手续发70余发。但陆上部队全无响应。陈炯明认为孙此举“冒险”、“轻率”，按兵不动。滇军第四师师长方声涛、旅长朱培德、张维新等亦不行动。其他部队表示中立。莫荣新令熄灭灯火，不许还击，同时打电话到海珠的海军办公室，请程璧光调处。程璧光急忙派“海琛”舰向“豫章”舰、“同安”舰传达“停止炮轰，开回省城”的紧急命令。两艘军舰得不到陆军响应，只得开回省城。
次日，各界要人及中华革命党元老们对这一事件进行调解。孙中山向桂系提出五个条件：（1）承认军政府为护法各省的最高领导机构；（2）承认大元帅有统率军队的全权；（3）承认广东督军由广东人选任，必要时大元帅得加以任免；（4）被捕民军代表交军政府处理；（5）广东外交人员由军政府任命。莫荣新表示，第一至第三条须向陆荣廷请示；第四、第五条修改为“须得军政府的同意”。莫亲自到大元帅府向孙中山道歉问疾，并答应接济元帅府卫兵月饷2万元。在此之前，莫荣新还说：“孙某之政府，空头之政府也。彼无兵无饷，吾辈但取不理之态度，彼至不能支持时，自然解散而去。”
9日，孙中山在大元帅府招待军政及工商各界代表，指出军政府由于地方当局不合作，以致“形同虚设，贻误讨逆戎机”。他表示这次炮击，“莫督军既未还击，又能接受条件，军政府有了生路，也就不必苛求了”。
5月4日，广东政学系与桂系军阀联合召开国会非常会议，出席议员80余人，汤漪提出《修正军政府组织法案》，赞成改组军政府者40余人，超过4票通过。改设七政务总裁，排斥孙中山。孙中山当日将大元帅辞职咨文送交国会，并通电辞职。
通电说：个人之去就其义小，国家之存亡其义大，文之所以忍辱负重以迄于今者，良以责任无人，非得已也。兹仍愿以匹夫有责之身，立于个人地位，以尽其扶助民国之天职。谨略述颠末，向国会非常会议辞大元帅之职。
7日，留沪国会议员林森、田桐等27人，通电要求挽留大元帅孙中山，“不许其辞职”，并要求延期改组军政府。但留粤国会非常会议于18日通过军政府组织法12条，其名称仍用军政府，变大元帅制为政务总裁制，而主席总裁则由政务会议选出。
20日下午，全国非常会议举行总裁选举会，出席议员120余人。选举结果，孙中山及唐绍仪、伍延芳、唐继尧、林葆怿、陆荣延、岑春煊7人当选。随后，陆、唐又推岑春煊为主席总裁。孙中山虽被选为政务总裁，但已无实际权力。护法军政府完全为军团、官僚所控制，成为与北洋军阀相妥协的议和机构。
5月21日，孙中山愤然离开广州，到汕头与陈炯明会见。6月1日，赴日本；26日，由日本返回上海，居法租界。护法运动失败。
2月2日，程璧光、唐绍仪、伍廷芳、莫荣新等邀请孙中山开会，讨论军政府改组事宜：一、改元帅名称为政务总裁，下设总裁若干人。二、联合会议之职，权限于军事范围，隶属于合议政府之下。8日，国会非常会议议决改组军政府大纲：（一）采用合议制，改组军政府。（二）以改组之军政府执行对内对外政务。护法各省联合会议认为军事机关属于军政府。（三）由伍廷芳、唐绍仪、程璧光、吴景濂四人通电护法各省征求同意，再由国会非常会议正式通过条文。同日，伍廷芳、唐绍仪、程璧光联名电告西南各省，宣布《中华民国军政府组织大纲修正案》7条，并说明该修正案改组军政府之用意在于：（一）改单独制为合议制，改大元帅为政务总裁若干人组织政务会议，地位平等，共同负责。（二）护法各省仍派代表组织联合会，其议决事件由政务会议施行。9日，伍廷芳、唐绍仪、程璧光、吴景濂将国会非常会议议决之军政府改组大纲电告西南各省征求同意，并谓：“尚希从速赞成，俾统一机关早日成立，则护法前途，大有衬裨益。”
1月，阎锡山确立了“六政三事”政策，并在全山西推广。“六政”，即：水利、种树、蚕桑、禁烟、天足、剪发；“三事”，即：种棉、造林、牧畜。为推行办理“六政三事”，阎设总的专管机构“六政考察处”。由于推行上述政策，山西农业有了较大改观。
11月11日，德国与协约国签订停战协定，第一次世界大战结束。消息传到北京后，各界群众欢欣鼓舞，庆祝战胜德国。14至16日，北京各校放假3天。15、16两日，北京大学师生在天安门举行庆祝胜利大会。蔡元培在大会上发表演说，认为“此后的世界，全是劳工的世界呵！“只用自己的劳力作成有益他人的事业，不管他用的是体力、是脑力、都是劳工。”要认识劳工的价值。劳工神圣！”胡适等人也在大会上发表演说。
11月16日，徐世昌下令全国庆祝。命令说：“我协商国士兵人民，不惮躬冒艰险，卒以公理敌强权而获此最后之胜利。吾国力排众难，加入战团，与兹盛举，是堪欣幸。”总理钱能训在众议院的演讲中也说：“此次欧战，中国幸能随同最讲公道、最爱和平各友邦，以与专尚武力、凭凌弱小之国角斗，是为我中国最有荣幸之事。”23日，国务院发出通告：“庆祝欧战完全胜利，所有各机关应放假一日。”
28日，北京政府在紫禁城太和殿前举行阅兵式。美、英、法、意、日等国士兵参加受阅，中国士兵以段祺瑞为总指挥。同时，内务部发出训令，要求各类宗教团体均于12月1日举行祈祷仪式。训令说：“欧战告终，各协约国教堂皆行祈祷之礼，吾国对德宣战，与各协约国立于同一地位，各省区宗教团体届期亦应一律举行祈祷。”虽然中国以战胜国自居，但中国并未派一兵一卒参战。
